38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4737 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  418  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  49.26 
 
 
203 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  45.19 
 
 
208 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  45.1 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  44.33 
 
 
203 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  44.12 
 
 
214 aa  158  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  44.61 
 
 
207 aa  157  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  41.87 
 
 
199 aa  154  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  42.03 
 
 
210 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  41.87 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  37.68 
 
 
210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  40.1 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  40.48 
 
 
216 aa  148  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  37.75 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  38.24 
 
 
210 aa  145  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  38.33 
 
 
234 aa  144  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  38.92 
 
 
207 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  39.52 
 
 
207 aa  141  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  37.13 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  41.67 
 
 
209 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  41.95 
 
 
211 aa  137  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  40 
 
 
206 aa  134  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  40.2 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  42.93 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  40.11 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  36.27 
 
 
210 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  33.65 
 
 
210 aa  121  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  32.21 
 
 
207 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  33.01 
 
 
213 aa  95.9  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  34.22 
 
 
170 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  28.34 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  29.41 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  28.34 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  31.41 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  37.5 
 
 
155 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  35.29 
 
 
132 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  36.36 
 
 
156 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 
267 aa  41.6  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>