More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3611 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
267 aa  540  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 
273 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
273 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  29.93 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  29.93 
 
 
274 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  32.01 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 
269 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  31.01 
 
 
257 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 
269 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
270 aa  118  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  29.64 
 
 
289 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  28.27 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  30.71 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
269 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
269 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  28.21 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
269 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 
269 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
281 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  25.19 
 
 
258 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
279 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  28.99 
 
 
273 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  28.87 
 
 
280 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
280 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  26.15 
 
 
286 aa  97.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  27.44 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
289 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  29.97 
 
 
314 aa  92.4  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  24.45 
 
 
262 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  24.73 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24.64 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  32.68 
 
 
155 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  22.51 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  27.87 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.53 
 
 
279 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  22.91 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  23.9 
 
 
292 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  21.98 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  24.1 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
276 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  22.74 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1352  transcriptional regulator, MerR family  25.83 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0877122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  21.15 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  21.84 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25.91 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  22.71 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  22.01 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  26.81 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  22.83 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  24.57 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  20.49 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  24.91 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  50.68 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  22.26 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  30.61 
 
 
157 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2581  transcriptional regulator, putative  27.23 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0799223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  35.24 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  34.84 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  31.45 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  20.43 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  20.85 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  41.18 
 
 
369 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  25.29 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  20.21 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  22.92 
 
 
281 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  29.67 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  28.74 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 
107 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  32.54 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  40.85 
 
 
361 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 
148 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 
148 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  55 
 
 
64 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  35.09 
 
 
253 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  25.81 
 
 
178 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  28.76 
 
 
156 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>