195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1993 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  49.6 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  31.29 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  34.65 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  29.79 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  58.14 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  27.31 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  43.18 
 
 		 361 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  40.56 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  29.89 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  41.9 
 
 		 399 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  39.01 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  42.86 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  43.9 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  50.75 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  30.07 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  28.46 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  24.23 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  20.21 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  48.61 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  47.14 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  50.77 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  25.95 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  47.95 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  28.67 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  34.78 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  22.87 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 161 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  44.16 
 
 		 319 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  32.89 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 132 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>