More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0379 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 327 aa  615  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  39.67 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  40.72 
 
 		 399 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  43.86 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  40.91 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  38.28 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  45.65 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  32.22 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  35.58 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  40.67 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  45.36 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  55.07 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  40.86 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  49.38 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 276 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 277 aa  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  46.73 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  40.74 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  28.74 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  39.1 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  28.97 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  33.09 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  29.49 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.55 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  45.12 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  40.24 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  22.93 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 132 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  47.14 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  18.26 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  25.35 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4563  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  18.37 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0002  DNA polymerase III, beta subunit  20.68 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  25.96 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  37.72 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  39.24 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 156 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 152 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  45.21 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>