More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20290 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  39.27 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  34.11 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  31.88 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  31.52 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  36.03 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  45.3 
 
 		 369 aa  95.5  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  60.56 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  44.12 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  46.6 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  37.42 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  29.75 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  28.65 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  47.37 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  46.07 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  26.57 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  36.57 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  48.61 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  27.31 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  37.89 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  28.36 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  22.01 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  28.71 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  43.59 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  41.24 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  39.13 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  42.25 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  38.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  36.75 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  30.66 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  34.91 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  22.63 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.99 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  37.23 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 		 132 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13800  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  30.87 
 
 		 142 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 134 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  22.26 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 139 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.04 
 
 		 139 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 399 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  34.86 
 
 		 129 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  20.53 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>