230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5383 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 266 aa  518  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  32.13 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  39.2 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  37.56 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  42 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  52.17 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  50.7 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  48.61 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  33.6 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  39.33 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  41.53 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  23.95 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  37.41 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  42.42 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  34.52 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  47.95 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  26.03 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.39 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  41.41 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  42.25 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  25.34 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  43.66 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  46.15 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  26.03 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  41.6 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  33.67 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  38.21 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  41.41 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  26.45 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  30.1 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  40.96 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  24.66 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  27 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  38.37 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  44.44 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 354 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  37.76 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  27.33 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16760  predicted transcriptional regulator  35.87 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.498002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  37.21 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  41.54 
 
 		 224 aa  53.1  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  30.1 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  31.63 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  45.57 
 
 		 268 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13800  predicted transcriptional regulator  43.53 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  33.09 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>