211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2898 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 282 aa  569  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  32.13 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  48.24 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  35.76 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  44.16 
 
 		 361 aa  68.9  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  32.37 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  45.21 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  36.79 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  34.84 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  39.39 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  40.45 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  42.25 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  35.51 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  32.61 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  30.23 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  30.39 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  30.39 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  30.39 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  30.39 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16760  predicted transcriptional regulator  34.74 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.498002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  34.88 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  32.89 
 
 		 150 aa  52.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  40.91 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  24.35 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  26.38 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  32.69 
 
 		 129 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  41.79 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  27.08 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 135 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  38.57 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  28.77 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  28.77 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  31.46 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  29.37 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  28.77 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  27.7 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  33.68 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13800  predicted transcriptional regulator  33.06 
 
 		 297 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 117 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  39.71 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  32.98 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 138 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 129 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>