More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0247 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
287 aa  585  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  33.45 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  34.22 
 
 
276 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  28.17 
 
 
269 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  28.17 
 
 
269 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  34.39 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  29.02 
 
 
269 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
269 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
269 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  33.67 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  31.99 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  26.86 
 
 
269 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
270 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 
293 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  30.6 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  27 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  27 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  31.83 
 
 
289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  28.67 
 
 
274 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  26.5 
 
 
269 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  32.59 
 
 
283 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
279 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  25.7 
 
 
270 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.83 
 
 
280 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  26.41 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  26.52 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
287 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  26.83 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  24.03 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  29.31 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  27.66 
 
 
258 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  29.34 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
132 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.7 
 
 
279 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  28.62 
 
 
262 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  24.34 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  23.15 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  28.08 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  25 
 
 
273 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 
264 aa  79  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  36.02 
 
 
224 aa  78.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  27.87 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  29.53 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  27.65 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  37.72 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  22.1 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  29.81 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
161 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  41.25 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  24.83 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2581  transcriptional regulator, putative  22.81 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0799223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  23.46 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  26.79 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
342 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0345  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 
247 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  24.14 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  23.79 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  23.46 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  36.27 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  46.05 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  40.23 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  34.86 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  47.14 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  48.53 
 
 
354 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  40.45 
 
 
271 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  45.35 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 
252 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  25.74 
 
 
275 aa  62.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  39.33 
 
 
361 aa  62.4  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  24.61 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  40.21 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
276 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  25.59 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>