161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0345 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0345  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 247 aa  474  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  30.99 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  27.6 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  30.35 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  21.15 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  44.83 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.88 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  42.27 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  21.5 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  29.57 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  30.67 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  32.34 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  27 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24.83 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  32.88 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 274 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 132 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 339 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 354 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 128 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  39.29 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  23.66 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  25.21 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  37 
 
 		 334 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  45.28 
 
 		 361 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 354 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  45.61 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 147 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 132 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 129 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 159 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  29.41 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  35.71 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 138 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  41.38 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  43.86 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  43.4 
 
 		 361 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 133 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  42.65 
 
 		 336 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  41.51 
 
 		 355 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  43.4 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  21.95 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  21.95 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  41.51 
 
 		 369 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 145 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4563  transcriptional regulator, MerR family  34.41 
 
 		 150 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  21.95 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 336 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  39.66 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  44.23 
 
 		 327 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 134 aa  45.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  21.95 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>