More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4099 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  100 
 
 		 276 aa  553  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  48.9 
 
 		 272 aa  254  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  49.12 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  54.01 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  48.91 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  46.95 
 
 		 282 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  48.25 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  29.02 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.11 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  26.83 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  29.58 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  26.24 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  27.21 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  27.05 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  26.62 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  29.01 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  27.18 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  27.78 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  27.74 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  31.67 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 132 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  26.69 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  31.76 
 
 		 258 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  30.45 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  30.58 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  26.79 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  25.98 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  25.62 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  24.48 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  32.49 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  30.72 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 161 aa  85.9  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  25.65 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  29.93 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  24.1 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  32.16 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  30.6 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  27.56 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  28.95 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.01 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  28.88 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  42 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0345  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  28.46 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  31.34 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 333 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  36.08 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  31.12 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  38.38 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  38.32 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  43.82 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  24.09 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  38.38 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  38.84 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  38.38 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>