More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0226 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
276 aa  568  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  32.33 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  30.92 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  34.81 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  30.82 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  30.82 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  31.29 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  35.42 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16760  predicted transcriptional regulator  42.35 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.498002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 
267 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  31.25 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
161 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  32.43 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  30.47 
 
 
272 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  31.07 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  32.46 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  44.12 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  35.42 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  42.65 
 
 
361 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 
327 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 
279 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  27.59 
 
 
270 aa  59.3  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  30.23 
 
 
267 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
251 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
251 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
132 aa  59.3  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
354 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
173 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 
254 aa  58.9  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  35.77 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
355 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  34.94 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  31.86 
 
 
395 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  35.11 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  33.73 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  25.21 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  32.76 
 
 
273 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  26.05 
 
 
247 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  36.99 
 
 
346 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
247 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  26.09 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
277 aa  55.8  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
256 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  35.21 
 
 
369 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>