More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1222 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  62.55 
 
 
253 aa  316  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  65.2 
 
 
251 aa  315  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  62.75 
 
 
252 aa  308  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  60.73 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  58.57 
 
 
258 aa  284  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  58 
 
 
253 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  57.94 
 
 
253 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  55.02 
 
 
259 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  54.07 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  48.02 
 
 
251 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
251 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
257 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  46.33 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  47.6 
 
 
271 aa  208  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 
268 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 
274 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  43.95 
 
 
278 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  36.18 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  38.1 
 
 
243 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  38.1 
 
 
243 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  37.7 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  37.7 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  38.1 
 
 
243 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  36.95 
 
 
243 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
241 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  37.9 
 
 
244 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  36.95 
 
 
243 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  36.95 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
245 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  33.6 
 
 
254 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  37.45 
 
 
272 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 
259 aa  142  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
258 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  32.55 
 
 
255 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  35.22 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  31.87 
 
 
254 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  59.17 
 
 
377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 
252 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  29.48 
 
 
253 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  34.51 
 
 
244 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
258 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
238 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  56.2 
 
 
429 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
237 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
250 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
256 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  27.89 
 
 
250 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  30.9 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
253 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  27.89 
 
 
249 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
270 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 
252 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  27.87 
 
 
284 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  36.5 
 
 
261 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  35.8 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
251 aa  92  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  32.51 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
254 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
254 aa  89  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
254 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 
253 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 
253 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  37.07 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
253 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
251 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  54.29 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  45.19 
 
 
354 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
252 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1629  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32.17 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651813  normal  0.0608845 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  43.18 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  36.29 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
336 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  37.84 
 
 
395 aa  79  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  43.18 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  51.39 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  50.72 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  43.18 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  43.42 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  33.79 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  36.54 
 
 
398 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  34.91 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  32.87 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>