More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3432 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  47.01 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  34.13 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  35.63 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  34.78 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  35.22 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  34.94 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  35.22 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  35.22 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  35.77 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  34.66 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  34.66 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.98 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  33.97 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 270 aa  131  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  32.95 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  32.02 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  30.86 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  28.85 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.45 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  31.33 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  48.8 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  29.32 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  33.47 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  29.55 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  27.67 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  44.21 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  26.07 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  43.88 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  24.9 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  26.24 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  26.4 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  23.17 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  24 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  35.83 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  24.44 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  26.59 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  33.61 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  26.92 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  27.76 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  26.46 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  40.57 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  43.04 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  35.48 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  27.24 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  28.51 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  34.68 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  32.23 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  24.8 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 107 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  31.4 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>