More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1098 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  82.81 
 
 		 256 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  82.8 
 
 		 250 aa  390  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  39.27 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  38.4 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  37.66 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  37.24 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  37.24 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  37.24 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 258 aa  144  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  35.98 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  35.98 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  35.98 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  35.98 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  34.52 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  35.98 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  34.4 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.58 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  31.43 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  32.13 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  30.45 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  33.07 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  32.37 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  32.4 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  32.92 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  28.34 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.22 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  28.75 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  29.17 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  27.12 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  28.75 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  32.02 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  31.12 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  33.2 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  29.8 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 238 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  30.8 
 
 		 244 aa  85.1  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  35.5 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  24.39 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  37.82 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  25 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  26.34 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  39.82 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  40 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  39.05 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  27.32 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  32.79 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  45.12 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  41.11 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>