More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4442 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  62.55 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  55.24 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  56.05 
 
 		 252 aa  285  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  59.51 
 
 		 251 aa  284  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  53.17 
 
 		 253 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  52.8 
 
 		 258 aa  263  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  53.17 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  46 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  49.19 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  50 
 
 		 259 aa  222  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 268 aa  218  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  45.95 
 
 		 270 aa  208  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  46.59 
 
 		 271 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  43.15 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  42.04 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  34.52 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  34.68 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  33.46 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  33.86 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  33.46 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  33.86 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  33.46 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  32.94 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  34.13 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  33.85 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  28.92 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  35.63 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  37.45 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  35.2 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  31.33 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  36.93 
 
 		 252 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  32.66 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  32.39 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  35.04 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  29.37 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  31.56 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  47.93 
 
 		 429 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  26.59 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  26.98 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 288 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  30.48 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  28.85 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  32.16 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  40.18 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 342 aa  82  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1629  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.72 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651813  normal  0.0608845 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  36.36 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  35.54 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  32.51 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  30.04 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  35.05 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  36.94 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  35.51 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  39.05 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 339 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  29.77 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  42.2 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  31.78 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  41.28 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 648 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  26.58 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>