More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3670 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 377 aa  744    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  94.52 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3108  Methyltransferase type 11  68.85 
 
 		 246 aa  302  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  51.81 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4208  Methyltransferase type 11  48.37 
 
 		 258 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0336  Methyltransferase type 11  53.01 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0390472  normal  0.038594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0837  Methyltransferase type 11  47.86 
 
 		 253 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.702425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  60 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  59.17 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  57.5 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  51.67 
 
 		 252 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 274 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  50.83 
 
 		 253 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  48.85 
 
 		 254 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  49.19 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  48.53 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  51.67 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 251 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 251 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  31.64 
 
 		 264 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 251 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 258 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  46.67 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  43.55 
 
 		 271 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 268 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  37.61 
 
 		 243 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  37.61 
 
 		 243 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 245 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  37.61 
 
 		 243 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 257 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  36.75 
 
 		 243 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  36.75 
 
 		 244 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  36.75 
 
 		 243 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  36.75 
 
 		 243 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  36.75 
 
 		 243 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  35.9 
 
 		 244 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 241 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 254 aa  93.2  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  25.48 
 
 		 249 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 		 255 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  42.98 
 
 		 272 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  37.24 
 
 		 244 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  33.07 
 
 		 254 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 256 aa  86.3  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  40.83 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  39.32 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  41.09 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  35.29 
 
 		 250 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  34.48 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  35.64 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  37.82 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 225 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  51.72 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 252 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  49.18 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  46.03 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  30.69 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  24.82 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  51.72 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  33.14 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  32.67 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  47.54 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>