More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4698 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
253 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  61.94 
 
 
251 aa  299  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  59.27 
 
 
252 aa  295  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  58.47 
 
 
252 aa  291  8e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  55.38 
 
 
258 aa  275  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  53.17 
 
 
253 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  57.77 
 
 
254 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  55.51 
 
 
259 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  52.96 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  53.47 
 
 
254 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  50.61 
 
 
251 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  50.61 
 
 
251 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  49.8 
 
 
251 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  45.6 
 
 
268 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  45.6 
 
 
257 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  47.88 
 
 
270 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  44.67 
 
 
274 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  46.77 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  43.03 
 
 
278 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  37.92 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  33.2 
 
 
249 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  37.6 
 
 
243 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  37.6 
 
 
243 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
245 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  37.2 
 
 
243 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  37.2 
 
 
243 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  36.8 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  36.9 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
258 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  35.6 
 
 
244 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  36.8 
 
 
243 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  36.4 
 
 
244 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  36.69 
 
 
255 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  34.27 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 
259 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  32.66 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  34.27 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  31.37 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
258 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  57.5 
 
 
377 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
250 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  35.83 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  54.55 
 
 
429 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  30.36 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  33.77 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  28.4 
 
 
250 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  28 
 
 
249 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 
250 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
253 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  27.6 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  30.04 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1629  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  36.11 
 
 
148 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651813  normal  0.0608845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
237 aa  87  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  31.33 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  35.77 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  34.41 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
630 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
659 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
630 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  38.89 
 
 
342 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
648 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  25.29 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  46.74 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  32.65 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
639 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>