More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0969 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  88.1 
 
 		 252 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  63.27 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  59.27 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  62.75 
 
 		 254 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  56.05 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  54.84 
 
 		 253 aa  262  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  50.41 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  53.25 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  49.19 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 257 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 268 aa  214  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  39.27 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  42.45 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  43.6 
 
 		 271 aa  184  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  40.47 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  36.48 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  36.44 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  35.89 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  33.87 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  34.38 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  33.59 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  33.98 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  34.38 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  34.52 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  35.2 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  33.98 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  33.98 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  34.12 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  35.37 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  30.92 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  30.83 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.98 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  32.74 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  35.39 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  28.22 
 
 		 250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  26.97 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  50.41 
 
 		 429 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1629  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  38.85 
 
 		 148 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651813  normal  0.0608845 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  35.17 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  30.12 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  36.02 
 
 		 261 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  29.24 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  27.89 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 288 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  27.38 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  47.52 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  29.1 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  48.42 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  40.59 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  46.58 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  40.43 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  32.65 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>