More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0264 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  510  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  31.84 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  31.35 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  29.67 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  33.07 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  30.61 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  30.16 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  30.56 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  30.61 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  30.61 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  30.61 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  29.08 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  28.29 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  25.98 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  25.41 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  23.53 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  26.42 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  26.54 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  26.22 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  22.22 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  22.62 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  23.08 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  23.39 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  26.91 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  25.1 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  23.45 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  25.99 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  24.6 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  26.14 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  20 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  21.65 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  25.36 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  21.81 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  38.18 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  51.56 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  30.99 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  24.6 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  38.78 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  32.09 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  19.54 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  28.78 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  47.14 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  25.48 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  20.73 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  25.1 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  49.18 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  23.98 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  34.55 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  37.18 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>