More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0065 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 
242 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  43.03 
 
 
253 aa  168  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  34.11 
 
 
253 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  36.64 
 
 
254 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  37.6 
 
 
243 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  37.6 
 
 
243 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
245 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  37.2 
 
 
243 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  37.2 
 
 
243 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
241 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  37.2 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  37.15 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  36.11 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  36.4 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  36.8 
 
 
244 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 
254 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 
253 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 
253 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  41.8 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  34.35 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  33.85 
 
 
250 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  33.85 
 
 
249 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  31.23 
 
 
249 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  35.5 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
255 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  35.97 
 
 
253 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
258 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  32.91 
 
 
254 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  33.73 
 
 
252 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 
258 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  33.47 
 
 
245 aa  115  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  32.95 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  38.13 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  35.88 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  33.46 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  31.69 
 
 
278 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.78 
 
 
259 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
268 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
256 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 
271 aa  101  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 
274 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 
256 aa  99  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  30.15 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  29.64 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  29.51 
 
 
272 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  33.89 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
254 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
253 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  40.2 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  45.07 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  30.92 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  39.22 
 
 
315 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  35.85 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  32.35 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  30.18 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  27.17 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  42.24 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  22.58 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  27.69 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  45.07 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>