More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0464 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 254 aa  523  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 258 aa  254  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  47.01 
 
 		 262 aa  238  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  40.16 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  40.32 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  40.16 
 
 		 243 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  40.16 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  39.76 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  39.76 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  38.43 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  39.76 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  39.76 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  39.76 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  34.78 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  35.69 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  34.1 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  42.17 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  36.64 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  36.64 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  34.24 
 
 		 258 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  33.47 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  35.04 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  33.87 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.76 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 251 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  50.39 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  32.77 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  29.69 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  38.73 
 
 		 284 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 238 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  44.79 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  43.06 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  30.12 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  27.72 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  26.36 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  41.82 
 
 		 314 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 288 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  30.47 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  43.16 
 
 		 315 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  35.95 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  29.53 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  42.11 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  41.58 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  41.58 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  40.59 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 377 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 429 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  36.28 
 
 		 398 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 648 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 659 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 639 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  41.05 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  30.87 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>