More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3285 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 272 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  50.78 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  47.49 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  46.59 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  43.24 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  46.61 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  37.92 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  37.2 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  38.27 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  37.45 
 
 		 254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  35.63 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  35.68 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  24.79 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  29.53 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  28.63 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  25.42 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  26.12 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  27.27 
 
 		 244 aa  94  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  24.19 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  29.85 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 245 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  24.79 
 
 		 244 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  24.69 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  25.1 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  24.69 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  24.69 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  25.1 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  24.79 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  25.21 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  25.71 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 241 aa  89  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 429 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  26.02 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  27.16 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  29.88 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  23.24 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  26.59 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  40.45 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  19.83 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  19.83 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  30.54 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  25.76 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  29.13 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  25.76 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  38.04 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  42.45 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  28.4 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  41.76 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  38.37 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 648 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  40.66 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  30.33 
 
 		 137 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  36.96 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  26.39 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  38.64 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  41.54 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>