More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0868 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 260 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 260 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 260 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  54.76 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  42.02 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  35.89 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  43.92 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  41.33 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  40.59 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 126 aa  99  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  37.81 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  42.55 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  30.18 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  49.32 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  44.76 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  35.29 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  43.88 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  43.12 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  39.53 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  39.66 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  32.18 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  38.46 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  41.82 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 		 135 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 144 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  29.15 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  32.84 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  38.82 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  33.91 
 
 		 133 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 149 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  39.18 
 
 		 130 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  27.46 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  36.28 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.28 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.28 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.28 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.28 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 136 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  36.28 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  38.46 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1385  transcriptional regulator of MerR family protein  38.04 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.55 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.32 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  39.18 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  36.04 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  33.11 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>