More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2662 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  51.79 
 
 		 249 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 256 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 254 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  54.46 
 
 		 264 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 260 aa  107  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  48.25 
 
 		 252 aa  106  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  50.45 
 
 		 258 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  50.89 
 
 		 265 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 254 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 260 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 260 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 260 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  42.72 
 
 		 249 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  63.64 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 		 260 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 251 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 254 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  35.64 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  48.98 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  49.06 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  50.98 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  36.78 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  46 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  33.63 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 308 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  31.62 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  32.76 
 
 		 368 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  27.27 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 342 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 246 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 343 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  59.46 
 
 		 246 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 304 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  53.66 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 342 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 257 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 342 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 342 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 342 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  56.41 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  43.86 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  43.1 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 253 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  28.1 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  28.1 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  28.1 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.1 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  34 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.1 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.1 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.73 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.1 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.81 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.81 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.81 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.81 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.81 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  27.27 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  32.04 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  41.38 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  29.29 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.87 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  27.27 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 343 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>