More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8430 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 251 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  38.74 
 
 		 249 aa  138  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  37.41 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  41.24 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  37.45 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  35.75 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  42.4 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  43.81 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  27.72 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  33.47 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  44.9 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  32.71 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  45.05 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  44.33 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  34.47 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  34.62 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  30.68 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 648 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  30.24 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  38.69 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  43.88 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  34.62 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  26.49 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  41.58 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  36.7 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  35.78 
 
 		 130 aa  72  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  36.97 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 126 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  37.12 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  42.55 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 138 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 149 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.26 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  35.29 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  41.9 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.32 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 343 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  37.9 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.6 
 
 		 162 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 149 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  37.38 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  39.6 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  41.28 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  37 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  38.1 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  50.57 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  48.48 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  38.64 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  41.12 
 
 		 156 aa  62  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  46.58 
 
 		 141 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  46.58 
 
 		 141 aa  62  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  46.58 
 
 		 141 aa  62  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  46.58 
 
 		 141 aa  62  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  46.58 
 
 		 141 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  39.8 
 
 		 144 aa  62  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  46.58 
 
 		 141 aa  62  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  46.58 
 
 		 141 aa  62  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>