More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2464 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
137 aa  276  9e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  45.67 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  48.25 
 
 
129 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  47.37 
 
 
129 aa  110  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  46.49 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
136 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
146 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 
148 aa  100  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
145 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  41.59 
 
 
129 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
141 aa  95.9  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
143 aa  95.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  44.04 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
135 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 
139 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 
129 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  41.32 
 
 
159 aa  93.6  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
172 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
186 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  41.44 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.02 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.02 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.02 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  41.9 
 
 
173 aa  90.5  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  38.02 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
138 aa  90.5  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 
176 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  42.73 
 
 
157 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  34.65 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 
144 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
149 aa  88.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 
159 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 
140 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  37.7 
 
 
146 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 
177 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
133 aa  88.6  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
146 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  34.62 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  33.6 
 
 
139 aa  87.4  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  37.01 
 
 
159 aa  86.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  33.33 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>