More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3400 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  95.54 
 
 
157 aa  306  8e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  93.63 
 
 
157 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  91.08 
 
 
157 aa  291  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  88.34 
 
 
163 aa  288  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  95.04 
 
 
176 aa  275  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  95.04 
 
 
171 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  95.04 
 
 
176 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  95.04 
 
 
171 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  82.31 
 
 
173 aa  248  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  79.59 
 
 
159 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  80.95 
 
 
158 aa  239  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  77.85 
 
 
159 aa  238  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  73.33 
 
 
171 aa  229  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  73.38 
 
 
177 aa  224  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  69.39 
 
 
153 aa  214  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  69.23 
 
 
144 aa  202  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.886267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  50.72 
 
 
141 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 
141 aa  144  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  50.72 
 
 
141 aa  144  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  50.72 
 
 
141 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  50.72 
 
 
141 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  50.72 
 
 
141 aa  144  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  50.72 
 
 
141 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  50.72 
 
 
141 aa  144  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  50.72 
 
 
141 aa  144  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  52.55 
 
 
139 aa  143  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  52.27 
 
 
141 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  51.52 
 
 
132 aa  140  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  52.27 
 
 
141 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  52.27 
 
 
141 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  52.27 
 
 
141 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  52.27 
 
 
141 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  47.18 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  51.52 
 
 
133 aa  137  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 
141 aa  137  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 
144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 
141 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 
141 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  49.24 
 
 
132 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  48.31 
 
 
140 aa  120  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 
142 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 
155 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
131 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40 
 
 
130 aa  97.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
134 aa  95.5  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  39.69 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.76 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  37.98 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 
138 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.78 
 
 
162 aa  94.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 
135 aa  94.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 
154 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
135 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
135 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
135 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
135 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
135 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
135 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
135 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
149 aa  94.4  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
149 aa  94  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 
151 aa  94  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
172 aa  94  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  43.31 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  44.09 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  43.31 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  37.98 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
135 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  42.02 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
135 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
135 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
135 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 
133 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
135 aa  92  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  42.02 
 
 
129 aa  92  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  36.64 
 
 
157 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.3 
 
 
135 aa  91.7  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  39.1 
 
 
135 aa  91.7  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3479  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  39.06 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 
143 aa  90.5  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>