More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4229 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  56.68 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  47.64 
 
 		 241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 247 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  41.96 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  43.98 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  43.39 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  34.52 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  46.08 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  43.81 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  35.05 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  42.22 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  42.7 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  41.67 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  27.82 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  36.46 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  39.47 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  38.55 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  43.86 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  30.77 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  26.79 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.16 
 
 		 162 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 149 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  31.25 
 
 		 129 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  28.04 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 138 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 173 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 343 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  28.83 
 
 		 347 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 141 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 133 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  39.71 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 175 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  28.86 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  37.88 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 134 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 140 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  29.91 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  32.26 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 136 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  43.33 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  29.91 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  39.08 
 
 		 150 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  28.67 
 
 		 133 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  36.36 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 135 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 147 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 154 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 145 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>