More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2640 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  48.75 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  29.45 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  24.71 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  27.86 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 137 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  33.98 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 146 aa  62  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 128 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  38.68 
 
 		 139 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  37.66 
 
 		 133 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 133 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  38.1 
 
 		 142 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  26.87 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 133 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  37.66 
 
 		 142 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 139 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  28.03 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  37.14 
 
 		 136 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 139 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  44.16 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  32.63 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  26.15 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  38.24 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.09 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  26.47 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  27.73 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  32.43 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  33.9 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  39.13 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  30 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  29.7 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  35.51 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  40.85 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  29.2 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.2 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  29.2 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.2 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.2 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.2 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.2 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.2 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  29.37 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 136 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 135 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  30.36 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  27.48 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>