More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1155 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 128 aa  256  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 186 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  43.12 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  41.28 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  45.37 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  38.41 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
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NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  45.37 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  43.81 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  42.15 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  43.52 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  40.74 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2051  transcriptional regulator, MerR family  47.96 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2421  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  47.96 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.732276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.59 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  38.89 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  39.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
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NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  41.54 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  36.07 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3479  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  52.24 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  38.83 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  35.77 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
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NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
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NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
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NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
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