More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2326 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  306  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  42.97 
 
 
143 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
146 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
172 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  43.09 
 
 
148 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  43.09 
 
 
148 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
142 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
147 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
138 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
137 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  41.13 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
149 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  38.52 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  43.31 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 
133 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  37.9 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  40.48 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  41.91 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 
138 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  38.21 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.68 
 
 
162 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40.48 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 
186 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
154 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
154 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  39.52 
 
 
160 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
136 aa  89  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
137 aa  88.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  39.52 
 
 
160 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  38.71 
 
 
170 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.48 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.48 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
153 aa  87.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.48 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  38.21 
 
 
152 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  37.21 
 
 
131 aa  87  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 
143 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 
143 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
149 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
139 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.4 
 
 
149 aa  86.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.25 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.25 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  39.37 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.07 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.25 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.25 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  41.6 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  37.23 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.1 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.37 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>