More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02983 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 152 aa  303  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  67.76 
 
 		 152 aa  203  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  66.45 
 
 		 152 aa  200  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 152 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  73.28 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  67.88 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  55 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  53.24 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  51.13 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 171 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 171 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 141 aa  86.3  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  43 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  41.46 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  38.82 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  36.97 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  37.29 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  49.33 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  55.22 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  36.44 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  48 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  48 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  48 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  39.25 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  37.61 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  37.9 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  55.22 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  39.64 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  38.02 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  39.64 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  53.73 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  52.24 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  35.54 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  45.33 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  39.82 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  33.33 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  52.24 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  46.27 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  49.25 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  49.25 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  29.6 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>