More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4528 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
129 aa  259  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  68.22 
 
 
129 aa  185  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  65.12 
 
 
145 aa  178  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  57.36 
 
 
129 aa  150  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  53.49 
 
 
129 aa  147  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  51.94 
 
 
129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  57.36 
 
 
129 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  54.62 
 
 
130 aa  139  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  54.62 
 
 
130 aa  139  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  54.62 
 
 
130 aa  139  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
133 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
146 aa  107  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  45.38 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  44.26 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  40.57 
 
 
137 aa  94  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 
150 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
135 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
133 aa  88.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  37.14 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  40.18 
 
 
143 aa  84  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 
129 aa  83.6  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
143 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  37.86 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  44.34 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  44.34 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.83 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  44.34 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  37.29 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.29 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.29 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.22 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.32 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>