More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2454 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 159 aa  314  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 154 aa  174  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  60.43 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  51.91 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  55 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  52.14 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  51.43 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 120 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  38.35 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  42.39 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  42.39 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  37.39 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  34.96 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  38.74 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  45.07 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  42.71 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.59 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.21 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  34.68 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1995  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.414348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  36.29 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  35.11 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  35.11 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  35.11 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  33.87 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.61 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  28.76 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0323  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0420386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  32.14 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.82 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  40.22 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>