More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1150 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  47.24 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  46.09 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  42.22 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  42.19 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  42.96 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 136 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  42.22 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  42.22 
 
 		 177 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  39.71 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  47.12 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  44.54 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  39.2 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  39.39 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  39.2 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  41.18 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  42.02 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  39.71 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  42.02 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 137 aa  91.3  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  39.26 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  38.52 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.81 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  43.93 
 
 		 171 aa  90.5  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.02 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  37.12 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  44.76 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  42.02 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.34 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.75 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  42.99 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  41.09 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  40.34 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.84 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 154 aa  87.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 154 aa  87.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  37.8 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.5 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.5 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  37.6 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  37.6 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 151 aa  87  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  36 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>