More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3788 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  301  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  62.31 
 
 
144 aa  170  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
136 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1934  MerR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
142 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.210113  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  44.44 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  45.86 
 
 
144 aa  130  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
156 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1416  MerR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
175 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2090  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
143 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
153 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  43.07 
 
 
136 aa  119  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  41.13 
 
 
146 aa  99.4  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  31.54 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  36.72 
 
 
145 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.52 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  40.78 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  34.06 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  34.06 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  34.06 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  34.06 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  34.06 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  34.06 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  34.06 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  34.06 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  34.06 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  37.41 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  33.09 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  33.09 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  40.2 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  33.09 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  33.09 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  33.09 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  32.61 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
129 aa  84  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  39.22 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  40.78 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32.09 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  28.68 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  28.68 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  35.56 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  33.82 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  31.03 
 
 
159 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  31.88 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.79 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.79 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  36.79 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.79 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  30.28 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  30.99 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>