More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002186 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  100 
 
 
132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  91.67 
 
 
132 aa  241  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  81.82 
 
 
133 aa  223  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  74.05 
 
 
139 aa  202  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  52.27 
 
 
159 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  50.76 
 
 
144 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  52.27 
 
 
158 aa  141  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  53.03 
 
 
177 aa  140  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  50.76 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  46.97 
 
 
171 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  49.24 
 
 
157 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  49.24 
 
 
157 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  49.24 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  49.24 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  49.24 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  49.24 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  49.24 
 
 
156 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 
173 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 
157 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  46.97 
 
 
163 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  44.7 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  44.7 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  44.7 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  43.94 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
141 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  44.78 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  43.18 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  43.18 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  48 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  42.75 
 
 
135 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  44.53 
 
 
158 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  44.53 
 
 
158 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 
155 aa  94.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.69 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
134 aa  93.6  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
134 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
131 aa  92  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  38.17 
 
 
138 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
140 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  39.23 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.23 
 
 
134 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.23 
 
 
134 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
132 aa  90.5  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  38.58 
 
 
159 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  33.59 
 
 
170 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
136 aa  88.6  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
136 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  38.18 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  36.15 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  36.43 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 
160 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 
160 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
145 aa  87  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
136 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
136 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
136 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 
138 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 
142 aa  87  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  35.88 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  37.27 
 
 
129 aa  85.9  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  35.94 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  36.15 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  34.35 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  33.85 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  35.11 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>