More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2399 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
132 aa  266  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  47.29 
 
 
158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  47.29 
 
 
158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 
135 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  48.41 
 
 
155 aa  117  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  46.51 
 
 
143 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  46.09 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  46.62 
 
 
144 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 
141 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 
141 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  46.62 
 
 
141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  46.62 
 
 
141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
147 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  45.31 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  45.31 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
173 aa  106  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
149 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  41.98 
 
 
159 aa  105  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  41.98 
 
 
151 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 
144 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  42.52 
 
 
144 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
139 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 
141 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  42.19 
 
 
144 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
152 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 
141 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  43.41 
 
 
140 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 
141 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
131 aa  104  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 
158 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  40.77 
 
 
133 aa  104  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  43.55 
 
 
147 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  42.64 
 
 
141 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  41.41 
 
 
144 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  44.35 
 
 
134 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 
167 aa  103  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
135 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  41.41 
 
 
144 aa  103  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  42.64 
 
 
140 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  41.41 
 
 
144 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
153 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
136 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  41.41 
 
 
144 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
149 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  42.52 
 
 
133 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
137 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 
149 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
136 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
136 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  40.16 
 
 
135 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 
136 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  40.77 
 
 
139 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
140 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
157 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  43.31 
 
 
132 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
134 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
129 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  43.18 
 
 
142 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
141 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
132 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
174 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
137 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
141 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.52 
 
 
142 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  39.69 
 
 
159 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
133 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
172 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
142 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
157 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  43.55 
 
 
154 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.74 
 
 
154 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 
151 aa  100  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  41.41 
 
 
144 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
152 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 
141 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
137 aa  100  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  41.41 
 
 
162 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
144 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
155 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  44.7 
 
 
140 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  41.41 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  41.41 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  41.41 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>