More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0303 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 154 aa  318  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  60.14 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  60.14 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  42.96 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  36.22 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  36.43 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  36.57 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  39.25 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  31.06 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  30.53 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  30.77 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  32.06 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  35.19 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  33.59 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  34.06 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.58 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  27.69 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  32.56 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  30 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  32.31 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  29.23 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  33.83 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  31.01 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.82 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.54 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1385  transcriptional regulator of MerR family protein  36.29 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  39.18 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.82 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  30 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  35.64 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.08 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  35.19 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  32.33 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  34.26 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  29.45 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2090  MerR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>