More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00394 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  100 
 
 		 144 aa  300  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1934  MerR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.210113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  49.62 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  49.62 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2090  MerR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1416  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  34.11 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  34.11 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  32.09 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  29.2 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  29.63 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  34.29 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  31.47 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.78 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  29.32 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  29.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  29.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  30.53 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  33.01 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  29.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  29.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  29.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  29.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  29.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  31.67 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  29.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  29.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  30.37 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  31.01 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  30.09 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  30.71 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  31.11 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  28.36 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  30.83 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  28.36 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  26.36 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  34.29 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  27.82 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  29.63 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  25.87 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  25.87 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  25.87 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  29.1 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  26.87 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  31.54 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.87 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  27.82 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  27.82 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  27.82 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>