More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2233 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  283  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  40.32 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  36.15 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  37.5 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.43 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.72 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  36.72 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.72 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  37.98 
 
 		 151 aa  90.1  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 161 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  37.69 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.23 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  39.82 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  39.82 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  36.23 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 171 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  36.23 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  33.86 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  33.86 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 177 aa  87.8  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  37.21 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  37.12 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 173 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0089  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 137 aa  85.9  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.38 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  35.07 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  35.07 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  34.33 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.38 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  35.04 
 
 		 171 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  35.07 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  35.07 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  35.07 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  34.38 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  33.09 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 136 aa  83.6  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  36.43 
 
 		 171 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>