More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1790 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  98.58 
 
 		 161 aa  280  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  75.18 
 
 		 146 aa  204  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 141 aa  173  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  61.48 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  63.91 
 
 		 174 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  61.19 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  60.29 
 
 		 140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  59.56 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  58.39 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 134 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  50.37 
 
 		 140 aa  140  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 134 aa  140  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  53.97 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  52.38 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  54.33 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 139 aa  130  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  43.65 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  43.65 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 172 aa  103  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  38.52 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  43.65 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  44.19 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 150 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  41.09 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  42.52 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  46.9 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  46.02 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.02 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.46 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.64 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  42.86 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  40.15 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>