More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2300 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 140 aa  146  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 174 aa  146  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  53.49 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  57.48 
 
 		 141 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  55.12 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 161 aa  141  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  51.97 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  53.97 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 162 aa  132  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  48.82 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  51.18 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  48.03 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  46.46 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  46.46 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  46.92 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  42.97 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  50 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.09 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  41.86 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  41.86 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  41.86 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  40.48 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  47.66 
 
 		 186 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  40.6 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  40.77 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  39.37 
 
 		 157 aa  95.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 172 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  38.1 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  39.69 
 
 		 159 aa  93.6  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  39.85 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>