More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0800 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  284  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  91.18 
 
 		 140 aa  251  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  91.3 
 
 		 146 aa  239  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  57.03 
 
 		 172 aa  154  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  48.12 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  49.59 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  47.97 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  48.78 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 139 aa  116  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2562  MerR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 135 aa  110  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  50.82 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  46.51 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 130 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  49.62 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 135 aa  104  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.72 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  49.18 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  43.9 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  48.41 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 152 aa  103  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  47.62 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  45.45 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  48.36 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  44.72 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  42.06 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  44.35 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  42.74 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  47.54 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.36 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  43.09 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  42.64 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  41.94 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  48.36 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.77 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  48.36 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  48.36 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  48.36 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  48.36 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  46.15 
 
 		 162 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  45.9 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  47.54 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  38.89 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  40.32 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>