More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1338 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  70.15 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  70.15 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  69.4 
 
 		 144 aa  197  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  69.4 
 
 		 144 aa  196  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  70.15 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  69.4 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  68.89 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  70.15 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  70.15 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  70.15 
 
 		 162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  70.15 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  70.15 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  68.66 
 
 		 144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  69.17 
 
 		 151 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  69.4 
 
 		 144 aa  193  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  70.63 
 
 		 135 aa  190  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  69.4 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 135 aa  184  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  68.25 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  65.15 
 
 		 135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  66.14 
 
 		 135 aa  179  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 135 aa  173  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 146 aa  156  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 		 135 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  50.79 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  50.81 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  48 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  45.6 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  46.92 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  39.84 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  43.08 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 172 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.8 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  43.65 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.98 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  39.26 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 		 155 aa  94.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  42.4 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  41.6 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  42.64 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  37.78 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 173 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  37.04 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  39.69 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3542  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 132 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  42.11 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  35.94 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2562  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>