More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4341 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  92.96 
 
 		 144 aa  269  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  92.96 
 
 		 144 aa  269  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  92.96 
 
 		 162 aa  269  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  92.96 
 
 		 144 aa  269  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  92.96 
 
 		 144 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  92.96 
 
 		 144 aa  269  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  90.14 
 
 		 144 aa  263  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  90.85 
 
 		 144 aa  263  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  93.98 
 
 		 144 aa  260  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  90.14 
 
 		 144 aa  259  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  89.36 
 
 		 144 aa  258  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  93.23 
 
 		 144 aa  257  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  92.48 
 
 		 144 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  89.47 
 
 		 144 aa  246  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  78.2 
 
 		 136 aa  213  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  72.31 
 
 		 135 aa  200  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  74.22 
 
 		 135 aa  200  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  74.22 
 
 		 135 aa  200  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  69.17 
 
 		 135 aa  193  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  69.17 
 
 		 135 aa  193  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  65.19 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  69.17 
 
 		 135 aa  189  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  64.18 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 146 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  58.27 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  58.27 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  69.81 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  51.59 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  48.8 
 
 		 135 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  52.38 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  49.6 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 134 aa  120  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  49.23 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  41.67 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  41.98 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  45.38 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.98 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 167 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  42.4 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  41.6 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.23 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.4 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 172 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  48.48 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  37.12 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  38.17 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  38.41 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  49.06 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  38.4 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  37.4 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  34.53 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 158 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  37.69 
 
 		 133 aa  87  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 158 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>