More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0593 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  276  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 134 aa  169  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  57.66 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  50.37 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  49.63 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  50.75 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  50 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  58.88 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  48.51 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  48.55 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  51.2 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  45.24 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  44.8 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  49.06 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  40.15 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  38.58 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  47.17 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  47.17 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 154 aa  95.9  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 186 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 154 aa  95.9  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  37.01 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 144 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  40.29 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  42.52 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 150 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  40.16 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  34.85 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.8 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  34.68 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  40.78 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 155 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 134 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>