More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4119 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
137 aa  282  9e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  67.88 
 
 
134 aa  190  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  64.23 
 
 
137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  57.46 
 
 
140 aa  154  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  55.47 
 
 
161 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  54.74 
 
 
141 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  50.36 
 
 
142 aa  143  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  50.36 
 
 
142 aa  143  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
146 aa  142  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  50.36 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
138 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 
174 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  48.87 
 
 
141 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
157 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
142 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
140 aa  131  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
140 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
137 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  47.79 
 
 
140 aa  129  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
137 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
138 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  46.21 
 
 
141 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  45.19 
 
 
140 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  44.7 
 
 
139 aa  121  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  51.28 
 
 
132 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
134 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
140 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
162 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
140 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
139 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  44.88 
 
 
133 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
140 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
137 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
139 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 
144 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
136 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
138 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
149 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  42.75 
 
 
144 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
137 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
132 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
172 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
130 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  36.43 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
140 aa  90.1  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
129 aa  90.1  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
162 aa  88.2  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
152 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  37.3 
 
 
148 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  36.51 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  37.69 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  40.16 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
126 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 
156 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  37.98 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  32.09 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.38 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.43 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  37.01 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>