More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0211 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  70 
 
 		 146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  70.37 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  69.63 
 
 		 161 aa  193  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  58.39 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  55.47 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  56.93 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  59.26 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 174 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 137 aa  151  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  52.55 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  56.52 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 137 aa  143  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 138 aa  143  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  54.33 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 140 aa  130  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  56.19 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  45.04 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  44.27 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  41.27 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  41.27 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  44.64 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 147 aa  95.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  43.36 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  42.11 
 
 		 159 aa  93.2  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  42.52 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  39.06 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  41.22 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  45.87 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  38.1 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  41.22 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.01 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  40.46 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 140 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  40.46 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>