More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2470 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  276  7e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  65.65 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  51.22 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.46 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  39.85 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  39.06 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.28 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  45.24 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  44.19 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.52 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.6 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 158 aa  96.7  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 158 aa  96.7  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  40.77 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 173 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  39.69 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.41 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  39.69 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  38.93 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  42.22 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  39.23 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 171 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  39.23 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  39.23 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  40.94 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  42.4 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  37.78 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.65 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  41.44 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  40.65 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.74 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 134 aa  91.3  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.02 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 139 aa  90.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  42.34 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  40.77 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.12 
 
 		 162 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  38.17 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  39.26 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  40.77 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>